Thomas Bauer est professeur d'études arabes et islamiques à l'université de Münster et membre de l'Académie des sciences et des arts de Rhénanie du Nord-Westphalie.
Il a reçu en 2013 le prix Leibniz (la plus prestigieuse récompense pour la recherche en Allemagne) pour son livre "La culture de l’ambiguïté. Une autre histoire de l’islam", le prix Tractacus de l’essai philosophique pour "Vers un monde univoque", et le « WISSEN! » (prix allemand du livre de sciences humaines) pour "Pourquoi il n'y a pas eu de Moyen Age islamique".