Paul Philippot a consacré une grande partie de sa carrière à l'enseignement.
C'est à l'Université Libre de Bruxelles dont il est Docteur en Droit et en Histoire de l'art et Archéologie qu'il a principalement enseigné de 1955 à 1995.
Il étudie également à l’Istituto Centrale per il Restauro avec Cesare Brandi.
Il a travaillé à l’Institut Royal du Patrimoine Artistique, au Musée du Louvre, et comme Directeur adjoint de l’ICCROM (Centre international d'études pour la conservation et la restauration des biens culturels, Rome) de 1959 à 1971, avant d’en devenir Directeur général de 1971 à 1977.
Les ouvrages et articles publiés par le professeur Paul Philippot couvrent des domaines très variés.
La peinture flamande a constitué son premier centre d'intérêt. Son intérêt s'est étendu ensuite à la sculpture polychrome des Pays-Bas méridionaux.
Son interprétation originale de l'art des Pays-Bas s'est ainsi progressivement étendue, au gré des occasions de publication, à l'architecture, la peinture et la sculpture des XVIIe, XVIIIe et XIXe siècles.
Sa publication « Conservation des peintures murales », co-écrite avec Paolo et Laura Mora en 1977, constitue une clé importante pour la conservation. Il reçoit le Prix ICCROM en 1981.